基于掩码图像建模的CyCIF面板缩减和标记插补方法

Zachary S. Sims，Young Hwan Chang; 第18届计算生物学机器学习会议论文集, PMLR 240:1-9

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多任务引导的自监督表格学习，用于患者特定生存预测

You Wu，Omid Bazgir，Yongju Lee，Tommaso Biancalani，James Lu，Ehsan Hajiramezanali; 第18届计算生物学机器学习会议论文集, PMLR 240:10-22

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开放生物医学网络基准：用于基准测试生物医学网络数据集的Python工具包

Renming Liu，Arjun Krishnan; 第18届计算生物学机器学习会议论文集, PMLR 240:23-59

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解耦多模态变分自编码器中的共享和私有潜在因素

Kaspar Märtens，Christopher Yau; 第18届计算生物学机器学习会议论文集, PMLR 240:60-75

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使用蛋白质语言模型进行序列生成的调优策略评估

Andrea Nathansen，Kevin Klein，Bernhard Renard，Melania Nowicka，Jakub M Bartoszewicz; 第18届计算生物学机器学习会议论文集, PMLR 240:76-89

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用于学习细胞扰动数据解耦表示的监督对比框架

Xinming Tu，Jan-Christian Hütter，Zitong Jerry Wang，Takamasa Kudo，Aviv Regev，Romain Lopez; 第18届计算生物学机器学习会议论文集, PMLR 240:90-100

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用于癌症风险分层的生存排序的跨导方法

Ethar Alzaid，Muhammad Dawood，Fayyaz Minhas; 第18届计算生物学机器学习会议论文集, PMLR 240:101-109

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使用GAN创建更长的基因序列：主成分空间中的生成

Antoine Szatkownik，Cyril Furtlehner，Guillaume Charpiat，Burak Yelmen，Flora Jay; 第18届计算生物学机器学习会议论文集, PMLR 240:110-122

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关于可建模性和泛化性：药物协同机器学习模型是否利用了可用数据中的伪影和偏差？

Arushi G. K. Majha，Ian Stott，Andreas Bender; 第18届计算生物学机器学习会议论文集, PMLR 240:123-134

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多路复用免疫荧光图像中相似性搜索的多粒度方法

Jennifer Yu，Zhenqin Wu，Aaron Mayer，Alexandro Trevino，James Zou; 第18届计算生物学机器学习会议论文集, PMLR 240:135-147

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ViDa：使用生物物理信息深图嵌入可视化DNA杂交轨迹

Chenwei Zhang，Jordan Lovrod，Boyan Beronov，Khanh Dao Duc，Anne Condon; 第18届计算生物学机器学习会议论文集, PMLR 240:148-162

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使用二项式混合模型研究RNA剪接作为细胞多样性的来源

Keren Isaev，David A. Knowles; 第18届计算生物学机器学习会议论文集, PMLR 240:163-175

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基于模型的插补能够提高单细胞Hi-C数据中差异染色质接触识别的分辨率

Neda Shokraneh Kenari，Megan Andrews，Max Libbrecht; 第18届计算生物学机器学习会议论文集, PMLR 240:176-193

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TCR-BERT：学习T细胞受体的语法，用于灵活的抗原结合分析

Kevin E. Wu，Kathryn Yost，Bence Daniel，Julia Belk，Yu Xia，Takeshi Egawa，Ansuman Satpathy，Howard Chang，James Zou; 第18届计算生物学机器学习会议论文集, PMLR 240:194-229

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H-Packer：用于蛋白质侧链堆积的霍洛图形旋转等变卷积神经网络

Gian Marco Visani，William Galvin，Michael Pun，Armita Nourmohammad; 第18届计算生物学机器学习会议论文集, PMLR 240:230-249

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GUANinE v1.0：用于基因组AI序列-功能模型的基准数据集

eyes s. robson，Nilah Ioannidis; 第18届计算生物学机器学习会议论文集, PMLR 240:250-266

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使用“固定”任务改进Transformer二级结构预测

Juneki Hong，Dezhong Deng，David A. Hendrix; 第18届计算生物学机器学习会议论文集, PMLR 240:267-278

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表征基因组序列-活性模型的预测中的不确定性

Ayesha Bajwa，Ruchir Rastogi，Pooja Kathail，Richard W. Shuai，Nilah Ioannidis; 第18届计算生物学机器学习会议论文集, PMLR 240:279-297

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