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MT2:用于半监督细胞分割的多任务平均教师模型
多模态高分辨率显微图像细胞分割挑战赛论文集,PMLR 212:1-13,2023。
摘要
细胞分割对于生物和生物医学研究中的下游单细胞分析至关重要。最近,基于监督学习的图像分割方法取得了令人鼓舞的结果。然而,大多数方法依赖于密集的人工标注,这对于细胞分割来说极其耗时且昂贵。此外,现有方法通常针对特定模态进行训练,泛化能力较差。在本文中,提出了一种新颖的半监督细胞分割方法,用于分割来自多种模态的显微图像。具体而言,将平均教师模型引入到多任务学习框架中,命名为多任务平均教师模型(MT$^{2}$),其中分类头和回归头都被用于提高预测性能。此外,提出了新的数据增强和多尺度推理策略,以增强鲁棒性和泛化能力。在NeurIPS 2022细胞分割挑战赛的调优集上进行定量评估,我们的方法实现了0.8690的F1分数,这证明了所提出的半监督学习方法的有效性。代码可在\url{https://github.com/djh-dzxw/MT2}获取。